《RDG濒危物种少女》改编自荻原规子创作的同名轻小说，是一部融合了日本神话、民俗学与少女成长元素的奇幻动画。故事主角铃原泉水子是一名15岁的少女，自幼在熊野古道玉仓山深处由祖父抚养长大。她性格内向害羞，不擅长与人交往，并且拥有一种特殊的体质——只要情绪波动，周围的电子设备就会失灵。这种异于常人的特质让她一直与现代社会保持着距离。

即将升入高中的泉水子情窦初开，偷偷修剪了自己的刘海，希望以新形象迎接新生活。然而这个看似微小的改变，却成为她命运转折的契机。在祖父的安排下，她离开深山，进入东京的凤城学园就读。在那里，她与青梅竹马的少年相乐深行重逢。深行受命成为她的守护者，伴随她面对接踵而来的神秘事件。

随着剧情推进，泉水子逐渐了解到自己并非普通人类，而是被称为“濒危物种少女”的特殊存在，其体内寄宿着远古神灵的力量。她必须在自我认知、友情、爱情与责任之间寻找平衡，同时面对各方势力对她力量的觊觎。作品以细腻的笔触描绘了少女的内心成长，将日本传统神话与现代校园生活巧妙交织，呈现出独特的和风奇幻氛围。