《妮基塔》讲述了一个年轻女极刑犯被训练成顶尖杀手的故事。从小缺少父爱、年少不羁的尼基塔和朋友们在抢劫店铺时失手杀死闻讯而来的警察，被以杀人罪送入女子监狱。后来，她被一个代号为“Division”的美国秘密政府组织从死囚牢房中营救出来。组织伪造了她的死亡，并以全新身份强迫她接受严酷训练，成为执行暗杀任务的顶尖特工。

在一次次危险任务中，妮基塔逐渐发现“Division”背后的谎言与阴谋。她既要面对外部敌人的追杀，也要应对组织内部的监控与背叛。她渴望摆脱控制、找回真实自我，却不得不在良知与生存之间反复挣扎。剧集通过她的蜕变与反抗，展现了一个女杀手在黑暗世界中寻找自由与救赎的历程。