《恐影档案》讲述一位执着于攻克恐惧症的精神科医生，发明了一套极端暴露疗法装置，将患者强行置入他们最害怕的情境中，试图以毒攻毒。起初，几名重症患者似乎出现好转，但诡异事件接连发生：空荡的走廊传来耳语，治疗室里的影子不再跟随主人，患者开始描述同一个不存在的人。

随着实验深入，医生发现装置可能连接了某种未知存在，恐惧不再是心理问题，而是被“它”当作入口。当一位患者在治疗中离奇死亡，警方介入，医院封锁，医生却无法停止——因为他自己也成了实验对象。最终，他必须面对一个选择：关闭装置，让所有人永远困在恐惧里；还是走进自己最深的噩梦，找出藏在恐惧背后的真相。